מידי שנה מקיימת האגודה הישראלית להיסטוריה ופילוסופיה של המדעים כנס שנתי, המהווה מפגש בין חוקרים מן האוניברסיטאות ומוסדות המחקר השונים בארץ, מוזיאוני המדע, העיתונות והתקשורת; אנשי שטח מעבדה וספרייה; מדענים, אמנים ומחנכים. הכינוס הוא יום חגם של כל העוסקים בישראל במדע, בטכנולוגיה וברפואה בהקשרים ההיסטוריים, החברתיים, הפילוסופיים, הפוליטיים והתרבותיים שלהם.
בשלוש השנים האחרונות התקיים הכנס במוזיאון המדע ע"ש בלומפילד ירושלים.